Pemilihan jenis ikan air tawar yang ingin dibudidayakan itu sangat banyak. Pemilihan jenis ikan tergantung pada lahan yang tersedia, modal maupun keterampilan petani. Biasanya petani dengan modal cukup dan memiliki tenaga kerja terampil akan memelihara jenis ikan bernilai ekonomis tinggi. Ikan bernilai tinggi umumnya tingkat kesulitan penangkarannya pun tinggi sehingga perlu keterampilan tersendiri.
Secara umum, dari banyaknya jenis ikan yang dapat dibudidayakan tersebut, akan lebih mudah dipahami kalau dibagi menjadi beberapa kelompok sebgai berikut:
- Kelompok ikan berdasarkan makannya, terdiri atas:
- Pemakan Hewan atau binatang (karnivora)
- Pemakan tumbuhan (herbivora)
- Pemakan Segalanya (omnivora)
- Kelompok ikan berdasarkan sifat aktif saat mencari makan terdiri atas
- Nokturnal (pencari makan pada malam hari) seperti catfish da Cobitidae
- Diurnal (pencari makan pada siang hari) sepertiCyprinidae, Poecilidae dan Cichlidae
- Kelompok ikan berdasarkan tempat hidupnya terdiri atas:
- Senang loncat ketas permukaan air seperti panchax dan epiplatus
- Ditengah perairan seperti Characidae dancichlidae
- De dekat dasar perairan seperti Cobitidae dan cathfish
- Di dekat dasar perairan (senang di bebatuan atau diantara tanaman) seperti beberapa cichlidae
- Di dalam lubang seperti Anoptichtys jordani dan black ghost
- Kelompok ikan berdasarkan cara berkembang biak dapat dibedakan atas beberapa kelompok. Pengelompokkan ini sangat penting bagi pembudidaya karena sifat perkembangbiakan ikan tersebut, terutama pembenihan.
Ada tiga kelompok besr ikan berdasarkan cara berkembang biak, yaitu ikan yang mengeluarkan telurnya dan dibiarkan menetas sendiritanpa dijaga induknnya, ikan yang menjaga telurnya, dan ikan yang telurnya langsung berhubungan dengan salah satu induk.
Selain tiga kelompok tersebut, ada kelompok lain yang berkembang biakdengan bantuan pemijahan buatan atau stimulasi hormon karena sulit dipijahkan secara alami atau memijah sendiri. Kebanyakn ikan dalam kelompok ini masih belum atau kurang beradaptasi dengan lingkungan budi daya yang baru atau ikan liar (baru dibudidayakan). Beberapa contoh ikan dalam eklompok ini adalah bawal air tawar, balashark dan red finned shark.
